AF_AFQ74ZJ8F1

Computed structure model of COPII coat assembly protein SEC16

Refer to the legend below to interpret the coloring by pLDDT confidence scores.

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RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Sequence of
1    ​M​​S​​T​​E​​A​​K​​R​​R​​R​​N​11   ​Q​​K​​K​​K​​Q​​K​​Q​​K​​Q​​K​21   ​K​​A​​A​​E​​K​​M​​Q​​E​​Q​​A​31   ​S​​L​​E​​S​​T​​L​​G​​S​​P​​I​41   ​D​​V​​S​​I​​F​​E​​Q​​Q​​Q​​Y​51   ​G​​G​​A​​E​​D​​A​​E​​A​​A​​G​61   ​A​​A​​A​​A​​R​​E​​S​​A​​D​​E​71   ​S​​R​​G​​A​​S​​V​​E​​S​​S​​G​81   ​S​​T​​D​​N​​A​​I​​G​​D​​D​​R​91   ​A​​G​​S​​A​​P​​S​​P​​Y​​V​​A​101  ​V​​G​​D​​S​​A​​A​​V​​S​​T​​A​111  ​V​​E​​V​​S​​A​​P​​L​​Q​​D​​E​121  ​A​​F​​S​​A​​V​​D​​V​​E​​A​​T​131  ​E​​S​​P​​A​​S​​A​​L​​P​​A​​A​141  ​S​​V​​E​​E​​S​​E​​H​​V​​S​​I​151  ​A​​T​​P​​A​​E​​P​​S​​A​​A​​P​161  ​V​​A​​P​​E​​A​​A​​A​​S​​E​​E​171  ​N​​V​​V​​Q​​M​​A​​G​​E​​N​​G​181  ​T​​N​​P​​E​​A​​D​​V​​P​​I​​E​191  ​D​​E​​S​​N​​F​​L​​F​​G​​D​​S​201  ​P​​H​​S​​P​​L​​P​​W​​D​​D​​G​211  ​G​​A​​S​​D​​P​​E​​Q​​R​​P​​E​221  ​M​​T​​E​​E​​R​​P​​E​​L​​P​​T​231  ​F​​E​​E​​E​​R​​T​​Q​​H​​T​​S​241  ​L​​L​​P​​S​​T​​S​​N​​E​​H​​K​251  ​T​​P​​Q​​E​​A​​L​​S​​S​​E​​E​261  ​D​​Q​​A​​A​​E​​P​​E​​Q​​N​​I​271  ​G​​V​​C​​D​​G​​H​​A​​E​​D​​S​281  ​T​​V​​D​​V​​E​​W​​E​​Q​​H​​T​291  ​S​​S​​S​​E​​L​​F​​G​​E​​E​​H​301  ​D​​T​​P​​H​​S​​P​​L​​P​​W​​E​311  ​E​​Q​​E​​A​​A​​A​​P​​E​​E​​N​321  ​R​​S​​R​​M​​E​​E​​H​​K​​E​​S​331  ​I​​S​​G​​D​​E​​R​​D​​Q​​D​​V​341  ​P​​I​​T​​E​​D​​S​​A​​K​​T​​G​351  ​S​​L​​P​​E​​D​​T​​V​​P​​G​​E​361  ​N​​T​​P​​G​​D​​I​​P​​E​​T​​A​371  ​T​​S​​A​​K​​N​​V​​D​​F​​D​​S​381  ​A​​N​​G​​T​​G​​N​​V​​P​​V​​E​391  ​S​​Q​​A​​H​​S​​T​​T​​H​​T​​P​401  ​E​​E​​Y​​A​​A​​D​​S​​N​​S​​L​411  ​F​​A​​L​​E​​D​​D​​G​​G​​D​​F​421  ​L​​A​​E​​L​​S​​N​​G​​H​​D​​V​431  ​S​​S​​Q​​S​​A​​A​​D​​M​​L​​P​441  ​I​​D​​D​​N​​V​​P​​R​​T​​T​​F​451  ​D​​G​​A​​D​​A​​L​​A​​G​​P​​A​461  ​E​​T​​Y​​E​​P​​G​​D​​L​​F​​A​471  ​D​​E​​D​​T​​A​​E​​E​​P​​P​​W​481  ​A​​Q​​N​​T​​N​​P​​N​​V​​D​​T​491  ​S​​Q​​Q​​L​​P​​V​​S​​R​​S​​S​501  ​A​​E​​L​​S​​S​​S​​Q​​A​​A​​K​511  ​E​​T​​P​​G​​I​​E​​V​​P​​P​​P​521  ​M​​F​​W​​D​​E​​E​​S​​D​​S​​I​531  ​E​​A​​S​​N​​D​​Q​​L​​A​​F​​T​541  ​P​​V​​A​​Q​​R​​G​​K​​V​​T​​L​551  ​P​​D​​K​​K​​F​​S​​F​​L​​D​​N​561  ​D​​D​​D​​L​​L​​N​​D​​D​​E​​E​571  ​E​​E​​A​​N​​A​​G​​D​​Q​​P​​E​581  ​N​​D​​Q​​E​​N​​C​​D​​D​​D​​S​591  ​F​​L​​D​​S​​D​​E​​E​​P​​P​​L​601  ​L​​P​​P​​K​​A​​G​​K​​T​​T​​Y​611  ​T​​P​​S​​T​​Q​​V​​L​​G​​Q​​D​621  ​R​​S​​S​​Y​​D​​A​​H​​N​​L​​S​631  ​S​​S​​M​​A​​V​​S​​P​​A​​V​​A​641  ​A​​V​​T​​G​​Q​​Q​​Q​​F​​L​​P​651  ​G​​P​​P​​V​​P​​E​​K​​P​​K​​V​661  ​G​​K​​Y​​A​​L​​P​​K​​Q​​P​​N​671  ​P​​P​​P​​Q​​T​​N​​K​​G​​Y​​Y​681  ​A​​P​​T​​L​​G​​G​​V​​G​​L​​E​691  ​A​​T​​D​​K​​P​​P​​V​​L​​S​​V​701  ​N​​D​​E​​S​​V​​R​​R​​L​​E​​E​711  ​E​​K​​K​​K​​S​​D​​A​​Y​​D​​F​721  ​P​​L​​E​​L​​V​​K​​S​​K​​P​​K​731  ​P​​A​​K​​P​​V​​P​​V​​P​​S​​I​741  ​P​​S​​I​​V​​T​​A​​S​​Q​​P​​A​751  ​S​​R​​S​​F​​S​​P​​S​​D​​A​​Q​761  ​P​​V​​F​​S​​P​​E​​K​​A​​G​​I​771  ​T​​P​​L​​K​​P​​T​​V​​P​​P​​V​781  ​K​​N​​P​​Y​​Q​​P​​N​​F​​D​​G​791  ​N​​Y​​L​​S​​L​​V​​D​​A​​V​​N​801  ​S​​R​​T​​S​​S​​V​​Q​​Q​​N​​P​811  ​Y​​A​​P​​P​​P​​V​​N​​V​​G​​P​821  ​Q​​V​​T​​S​​E​​K​​P​​Y​​A​​A​831  ​Y​​E​​G​​A​​A​​S​​G​​S​​Q​​S​841  ​Q​​H​​P​​F​​P​​P​​Q​​P​​L​​G​851  ​A​​Y​​G​​T​​N​​A​​P​​K​​P​​P​861  ​L​​N​​S​​Y​​N​​L​​A​​A​​A​​Q​871  ​M​​D​​S​​P​​K​​E​​R​​R​​P​​A​881  ​A​​Y​​V​​N​​T​​S​​R​​T​​R​​A​891  ​I​​S​​N​​A​​S​​V​​G​​S​​S​​G​901  ​S​​Y​​N​​S​​H​​Q​​L​​P​​A​​G​911  ​P​​T​​V​​V​​P​​P​​R​​F​​A​​F​921  ​P​​P​​P​​Q​​A​​H​​I​​S​​P​​T​931  ​I​​P​​A​​L​​Q​​T​​V​​G​​I​​A​941  ​G​​A​​P​​P​​A​​V​​S​​S​​P​​G​951  ​T​​Q​​R​​R​​T​​H​​A​​R​​S​​H​961  ​S​​S​​V​​Y​​A​​P​​A​​N​​A​​P​971  ​H​​A​​S​​K​​Y​​A​​P​​T​​V​​H​981  ​P​​S​​V​​Q​​Q​​K​​Y​​P​​S​​V​991  ​A​​G​​P​​S​​K​​R​​S​​L​​A​​G​1001 ​N​​G​​V​​P​​D​​G​​V​​S​​N​​R​1011 ​V​​L​​P​​P​​T​​I​​Q​​E​​V​​P​1021 ​V​​D​​G​​H​​A​​L​​N​​F​​R​​Q​1031 ​F​​P​​L​​F​​N​​W​​S​​Q​​T​​S​1041 ​K​​I​​V​​Y​​G​​L​​S​​L​​P​​I​1051 ​D​​T​​G​​N​​Y​​M​​L​​G​​K​​P​1061 ​F​​P​​V​​S​​G​​I​​H​​V​​R​​N​1071 ​S​​E​​S​​I​​L​​V​​P​​N​​V​​I​1081 ​L​​K​​D​​F​​P​​G​​P​​L​​I​​K​1091 ​G​​K​​T​​R​​T​​K​​D​​L​​E​​K​1101 ​W​​L​​E​​L​​S​​I​​A​​Y​​Q​​R​1111 ​E​​S​​L​​P​​G​​R​​D​​L​​T​​L​1121 ​W​​Y​​V​​L​​K​​H​​K​​L​​S​​T​1131 ​S​​G​​S​​L​​R​​E​​L​​S​​K​​I​1141 ​L​​Y​​D​​S​​D​​Q​​L​​I​​P​​Y​1151 ​M​​G​​Q​​M​​H​​S​​H​​G​​R​​P​1161 ​T​​L​​L​​S​​H​​K​​L​​D​​P​​N​1171 ​S​​Q​​M​​Q​​I​​L​​A​​H​​L​​Q​1181 ​V​​G​​S​​P​​G​​A​​A​​L​​D​​L​1191 ​A​​L​​A​​Q​​K​​D​​Y​​A​​L​​A​1201 ​L​​V​​L​​S​​S​​L​​I​​G​​K​​D​1211 ​K​​W​​S​​E​​V​​V​​D​​T​​Y​​L​1221 ​R​​E​​E​​F​​S​​V​​S​​A​​G​​N​1231 ​N​​Q​​F​​S​​V​​Y​​L​​L​​A​​L​1241 ​I​​F​​Q​​V​​F​​V​​G​​N​​S​​N​1251 ​R​​V​​L​​Q​​E​​L​​T​​A​​N​​P​1261 ​L​​K​​R​​D​​W​​A​​I​​Q​​D​​W​1271 ​N​​I​​I​​L​​A​​A​​V​​L​​N​​N​1281 ​I​​P​​K​​D​​V​​D​​P​​R​​Q​​L​1291 ​P​​P​​V​​V​​M​​E​​F​​L​​V​​G​1301 ​F​​G​​V​​F​​L​​V​​Q​​S​​G​​K​1311 ​L​​A​​A​​G​​A​​V​​C​​F​​V​​I​1321 ​A​​N​​V​​P​​L​​S​​Q​​N​​E​​L​1331 ​L​​P​​H​​S​​G​​V​​K​​F​​E​​C​1341 ​L​​G​​S​​I​​N​​S​​L​​D​​A​​V​1351 ​L​​L​​S​​E​​V​​Y​​E​​Y​​Y​​Y​1361 ​T​​T​​I​​N​​D​​N​​C​​P​​F​​F​1371 ​A​​S​​L​​L​​L​​M​​K​​T​​V​​H​1381 ​A​​S​​A​​L​​L​​D​​Y​​G​​L​​P​1391 ​T​​T​​V​​P​​K​​Y​​L​​D​​V​​I​1401 ​T​​G​​L​​L​​R​​N​​A​​P​​K​​N​1411 ​S​​A​​I​​A​​V​​S​​L​​T​​H​​Q​1421 ​L​​E​​S​​I​​N​​L​​R​​L​​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Type

Model Confidence 
  •   Very high (pLDDT > 90)    
  •   Confident (70 < pLDDT ≤ 90)    
  •   Low (50 < pLDDT ≤ 70)    
  •   Very low (pLDDT ≤ 50)    

Computed Structure Models provide per-residue confidence score (pLDDT) between 0 and 100. Some regions below 50 pLDDT may be unstructured in isolation.

Citation:

See Citation Policies for referencing Mol*, RCSB PDB, PDB structures, and Computed Structure Models.